Hanna Lis dwukrotnie wychodziła za mąż. Przez 9 lat jej partnerem życiowym był Robert Smoktunowicz, prezenterka nosiła jego nazwisko. Za Tomasz Lisa wyszła w październiku 2007 roku. Związek z dziennikarzem rozpadł się 11 lat później.
Była kandydatka na prezydenta z ramienia Koalicji Obywatelskiej, Małgorzata Kidawa-Błońska skomentowała wynik wyborów w USA. Robert Smoktunowicz nie zostawił na niej suchej nitki.