Maciej Stuhr ma dwójkę dzieci - syna z drugiego małżeństwa oraz córkę z pierwszego związku. W najnowszym wywiadzie wyznał, jak wyglądały jego relacje z Matyldą po rozwodzie z jej matką oraz jak ich kontakty układają się obecnie.
Maciej Stuhr od kilku lat jest związany z dietetyczką Katarzyną Błażejewską. Mają synka Tadeusza. Aktor wychowuje jeszcze córkę z pierwszego małżeństwa. Matylda to aktywna w mediach społecznościowych 18-latka.